Před rozkliknutím v Dashi je ta duplicitní ikona se stejným názvem v kategorii aplikace? Není tam jako nějaký dokument? Pokud je opravdu dvakrát se stejným názvem v aplikacích, tak by měl být v /usr/share/applications/, nebo ~/.local/share/applications/ nějaký soubor *.desktop, ve kterém je definované stejné jméno, ale jiný spustitelný soubor. Pokud bych hledal anglický název Document Viewer, pustil bych na ty adresáře grep asi takto:
egrep -RHim1 "^Name.*Document Viewer" /usr/share/applications/
a případné nalezené podezřele vypadající spouštěče prozkoumal a nežádoucí zakázal.