Zdravím hibernaci bych taky nedoporučoval, jak u Windows tak u Linuxu. V notebooku mám 3 systémy, Windows 10, Linux Mint Mate a teď nově Ubuntu 16.04 Unity. Všechny systémy mám na SSD disku, a k tomu mám ještě plotnový disk.
Ve Windows i Linux mám namountovaný plotnový disk pro ukládání dat. Když jsem hibernoval Mint a poté spustil notebook, tak výběr v GRUBU mám nastavený na bootovaní do Windows, ale WIndows samozřejmě nenabootoval. Po nabootování zpětně do Mintu, už nešel datový disk připojit a po prohlednutí gparted na něm už nebyl žádný souborový systém, naštěstí se to povedlo opravit pomocí chkdsk, ale podle této zkušenosti bych hibernaci při dualboot už nepoužíval.