/usr/src/linux-2.6.18.3 klidne smazat muzete, jedna se pravdepodobne o pozustatek po nejake kompilaci, ktera potrebovala linux-headers resp. zdrojove kody jadra (tehdy 2.6.18.3), obecne co je v /usr/src/ jste si tam musel dat sam a pokud to tam nechcete, musite si to take sam smazat :-D
Jeste obcas take pomaha "sudo rm /var/cache/apt/archives/*"