No jasně - na 64bit programy. Wineprefixů si přece můžeš vytvořit kolik chceš a jaké chceš a do nich si instalovat programy dle potřeby.
---------------------------------------------------------------
Zkrátka si vytvoř dva wineprefixy, jeden 64bit a druhý 32bit a do nich instaluj programy (32bitové do 32bit wineprefixu, 64bitové do 64bit wineprefixu). Samozřejmě, aby se ti program v požadovaném wineprefixu spouštěl, je třeba ho spouštět příslušným příkazem (nebo spouštěčem s tímto příkazem), jinak se zase spustí v základním wineprefixu (~/.wine) bez ohledu na to kde je nainstalovaný.
Příklad příkazu:
env WINEPREFIX="/home/franta/.wine/wineprefixes/32_bit" wine "/home/franta/.wine/wineprefixes/32_bit/drive_c/Program Files (x86)/Můj_program/program.exe"
V prvních uvozovkách je cesta k wineprefixu, ve druhých je cesta k exáči programu. A hlavně, tohle (a mnoho dalšího) najdeš (překvapivě) na stránkách Wine - prosím běž tam a přečti si to..