V usr/bin si vyber nějakej prográmek (např. totem tam určitě je) a zkus na něj 2x kliknout a měl by se spusti (nejsou to složky jako v Programu Files). To nastavení eric v /home/uživatel nemusí 100% být, ale je určitě u všech větších programů.
S tím wolfíkem - to je přesně ono (žádné nastavení ve skrytých složkách v /home/uživatel). Když si stáhneš nějaký program z netu nebo nějak jinak, tak se může uložit do /usr/local - to už napovídá (to ruční naistalování v tomto případě) - není to "standartně" naistalovaný balík ze zdrojů (Synaptic, Přidat/Odstranit), proto se doporučuje co jde naistalovat ze zdrojů, naistalovat ze zdrojů - nemáš pak bordel v PC - Pokud není program ve zdrojích tak stáhnout z netu pokud možno něco.deb a ten se naistaluje také do /usr/bin, ale nevýhodou je, že se nemůže aktualizovat jako vše ostatní co je naistalováno ze zdrojů. A až jsou ostatní možnosti instalace - pokud možno nebrat (jako něco. tar.gz, něco. rpm atd.)