Jednou se mi tato hláška objevila na EE a vyřešil jsem to smazáním nastavení. Skuste v domovském adresáři "zazálohovat" tyto složky a smazat (po novém startu se vytvoří default nastavení gnome). Když to nevyjde, aby jste si mohli vrátit popř. nastavení zpět.
.gconf2 .gconf, .gconfd, .gnome, .gnome2