Editace PDF (pokud nepoužijete profi nástroje od Adobe) bude ještě dlouhou dobu nouzové.
Nezkoušel jsem Inkscape, ale pochybuji, že i on zvládne změnu odrážek, číslování a pod. formátování.
Překopírovat text z PDF do OO jde přes schránku. Číslování a odrážky se ale chovají jako znaky a nejsou zachovány mezery apod.
Píšete, že je třeba udělat podstané úpravy. Tam to bude asi nejlepší ta cesta přes kopii do schránky a nové formátování v textovém editoru.