Jistě, jenže ty disky musíte mít odpojeny, prostě systém se nesmí používat. Prostě nabootujte z LiveCD a obsah zálohy překopírujte do adresáře, kde je linuxová partišna pův.systému. Bude někde v /media/sdaXX.
Pozor na to, jak máte rozděleny disky, musíte dodržet stejně partišny, jinak to musíte opravit v /etc/fstab.
Info máte už dost, musíte zkoušet...
Teoreticky by to šlo z účtu root, ale to řešit nebudeme.