Protože vy jej neodstraníte, jen přesunete do koše. Pokud chcete opravdu odstranit, v nastavení Nautilu (resp. i Dolphinu, používáte-li Kubuntu) je možnost zapnout odstranění, které nepoužívá koš. Pak budete mít po kliknutí na soubor vždy možnosti dvě - odstranit nebo přesunout do koše.