XFS jsem v praxi nezkoušel, nicméně pro přenosné médium bych zvolil EXT4, tedy pokud je přes esata. Jinak, pokud by bylo připojeno přes USB, možná by byl lepší fs s menší režií, tedy EXT2. Já používám na přenosném hdd (WD 240GB) EXT4 bez problémů. Připadá mi i podstatně rychlejší, než když tam před časem byl NTFS a připojeno k Woknům XP. Asi jsem Vám moc neporadil, ale myslím, že v tomto případě bude nejlepší vlastní zkušenost. BTW - zkuste při formátování snížit počet inode - nevím, kolik a jak toho zálohujete, ale pokud zálohujete do nějakých komprimovaných archivů, tak to rapidně snižuje počet fyzických souborů, tím byste ušetřil místo.